Die Geschichte im Film Der Bergdoktor beginnt mit einem älteren Mann, Bernie, der mit ernsthaften Gesundheitsproblemen zu kämpfen hat, besonders mit Diabetes. Er sucht Dr. Martin Gruber auf, der immer bereit ist, den Menschen in der kleinen Gemeinschaft im Gebirge zu helfen. Nach der Untersuchung stellt Martin fest, dass Bernies Blutzucker zu hoch ist, und er muss seine Ernährung umstellen und eine strenge Diät einhalten, ansonsten muss er Insulin spritzen.
Die Geschichte dreht sich nicht nur um Gesundheitsprobleme, sondern auch um die komplexen Beziehungen zwischen den Charakteren im Dorf. Bernie fühlt sich zunehmend besorgt, da er merkt, dass seine Gesundheit nicht mehr wie früher ist und er die Einsamkeit spürt, da seine Kinder keine Zeit für ihn haben. Doch das Leben in den Bergen, auch wenn es schwierig ist, bringt ihm auch Ruhe und Verbundenheit mit neuen Freunden wie Dr. Martin, der immer bereit ist zuzuhören und zu helfen.
Eine der interessanten Szenen im Film ist das Auftauchen von Lisa, einer alten Freundin von Martin, die nach Innsbruck zurückkehrt und sich um Bernies Gesundheitszustand sorgt. Lisa und Martin müssen sich auch mit den Problemen der Vergangenheit auseinandersetzen, da sie ihre Beziehung nie wirklich geklärt haben. Doch durch Gespräche und gegenseitige Unterstützung erkennen sie, dass sie immer noch Verständnis und Freundschaft miteinander finden können.
Zusätzlich behandelt die Geschichte auch komplexe familiäre Beziehungen, wie die zwischen Paul und seiner Familie, wenn sich Lebenssituationen plötzlich ändern. Besonders die Sorgen der Menschen, wenn sie mit Krankheiten konfrontiert werden und wie sich das Leben überraschend schnell ändern kann, wird thematisiert.
In einer besonders emotionalen Episode ist Martin nicht nur Arzt, sondern auch Freund und Sohn des Gebirges, wo sich die Menschen in schwierigen Zeiten gegenseitig unterstützen. Der Film geht es nicht nur um Krankheit und Heilung, sondern auch um Freundschaft, Liebe und das Leben in einem abgelegenen Land.